中國電子口岸數(shù)據(jù)中心是海關(guān)總署、對外經(jīng)濟貿(mào)易合作部、國家稅務(wù)總局、中國人民銀行、國家外匯管理局、國家出入境檢驗檢疫局、國家工商行政管理局、公安部、交通部、鐵道部、民航總局、信息產(chǎn)業(yè)部等12個部委，利用現(xiàn)代信息技術(shù)，借助國家電信公網(wǎng)，在互聯(lián)網(wǎng)上建立的公共數(shù)據(jù)中心和數(shù)據(jù)交換平臺。
中國電子口岸數(shù)據(jù)中心深圳分中心（以下簡稱"深圳分中心"），于2003年3月7日正式成立，是中國電子口岸數(shù)據(jù)中心在全國41個分支機構(gòu)之一，具有獨立法人資格，經(jīng)費獨立核算，深圳分中心的主要職責(zé)如下：
一、實現(xiàn)深圳地區(qū)各有關(guān)部門間與大通關(guān)流程相關(guān)的數(shù)據(jù)共享和聯(lián)網(wǎng)核查。
二、規(guī)范電子口岸數(shù)據(jù)交換標(biāo)準(zhǔn)，將大通關(guān)核心流程及相關(guān)的物流商務(wù)服務(wù)程序整合到統(tǒng)一的信息平臺，實現(xiàn)全國“統(tǒng)一認(rèn)證、統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)、統(tǒng)一品牌”，為企業(yè)進出口通關(guān)提供“一卡通”、“一站式”服務(wù)。
三、承擔(dān)電子口岸的統(tǒng)一身份認(rèn)證業(yè)務(wù)，推進電子口岸平臺建設(shè)。
四、建立完善數(shù)據(jù)公開、使用授權(quán)和信息安全管理辦法，加強系統(tǒng)的安全管理工作，健全應(yīng)急機制，確保系統(tǒng)的安全穩(wěn)定運行。
五、承辦深圳關(guān)區(qū)政務(wù)卡、企業(yè)卡的錄入、制作等項工作。
六、負(fù)責(zé)深圳地區(qū)中國電子口岸應(yīng)用項目及聯(lián)網(wǎng)企業(yè)的技術(shù)支持、操作培訓(xùn)、熱線咨詢，及時收集、報告項目運行情況及各方反映。
七、負(fù)責(zé)深圳地區(qū)用戶集中托管服務(wù)器的運行、維護管理。
八、承接其他應(yīng)用軟件開發(fā)及技術(shù)服務(wù)工作。
九、負(fù)責(zé)深圳地區(qū)電子口岸的職能及相關(guān)承建工作。
十、承辦中國電子口岸數(shù)據(jù)中心交辦的其他事項。